V případech, kdy Řídicí orgán (dále jen „ŘO“) během realizace projektu příjemci nevyplatí část dotace podle §14e zákona č. 218/2000 Sb., o rozpočtových pravidlech¹ nebo protože se domnívá, že došlo ze strany příjemce k porušení rozpočtové kázně (dále jen „PRK“) a podá podnět Úřadu pro ochranu hospodářské soutěže nebo místně příslušnému orgánu finanční správy (dále jen „OFS“), který následně rozhodne, že k porušení zákona o veřejných zakázkách nebo k PRK nedošlo, může ŘO na základě nových skutečností či důkazů přehodnotit původní závěr o nezpůsobilosti výdajů či změnit původní výši nezpůsobilých výdajů a uznat nárok příjemce na vyplacení pozastavené či dosud nevyplacené/snížené² části dotace, a to až do výše nároku dle platného znění Rozhodnutí o poskytnutí dotace.

Pokud příjemce již provedl finanční vypořádání dle vyhlášky č. 367/2015 Sb., ŘO vyplatí pozastavenou či dosud nevyplacenou/sníženou část dotace prostřednictvím mimořádné žádosti o platbu. Současně s touto mimořádnou žádostí o platbu dojde ke schválení dotčených výdajů ve vyúčtování. Takto jsou vždy vyplaceny prostředky stejného charakteru s prostředky, které byly pozastaveny či dosud nevyplaceny/sníženy.

Jsou-li dotační prostředky vypláceny po finančním vypořádání, je příjemce povinen finanční vypořádání podle vyhlášky č. 367/2015 provést znovu, a to k 31. prosinci toho roku, ve kterém byly dotační prostředky příjemci doplaceny (vyjma projektů financovaných ex-post).

  ¹ Ve znění účinném ke dni nevyplacení.

  ² Snížení dotace ve smyslu Oznámení o snížení dotace.